Два варианта: ждать новую версию CS Cart, либо применить патч, чтоб модуль “Зависимость” работал с новым чекаутом.
Есть инструкция, как применить diff: Как применить diff-файл — Документация docs.cs-cart.ru 4.9.x
52d410fbb20ad9cbc739cebbd9a671a6724b8efa.zip (500 Байт)