Где возникла проблема: на всех версиях включая CS-Cart 4.17.2.SP1 а также на вашем демо https://dev.demo.cs-cart.ru/stores/2522be3a7d825a55/
Суть проблемы: На домашней странице, при настройке заполнения контента блока Хитами продаж вариации как один товар могут выводится / дублироваться в блоке все размеры которые были куплены одного и того же товара
Как воспроизвести проблему: Переходим в редактирование блока на главной странице, например “Распродажа”, во вкладке “Контент” Выбираем “хиты продаж”. Оформляем заказы на разные размеры одного и того-же вариационного товара (например футболка белая), после чего данные размеры одного и того-же товара отображаются в данном блоке как отдельные товары. Такое поведение логично для вариаций как отдельные товары (например по характеристике цвет) , но никак не для вариации как один товар (например для хар-ки размер)