Вообщем необходимо перенести некоторые скрипты, а найти файл в котором они подключаются не смог. Смотрел location.tpl ну и footer.tpl.
Вообще система собирает скрипты со всех шаблонов (если не указан data-no-defer) и перемещает их в футер автоматом. Поэтому ответ на ваш вопрос зависит от конкретного скрипта
Тоесть насколько я понял мне нужно найти блок в котором используется сам скрипт, следовательно там и искать его подключение?
Да, все верно