Где возникла проблема: Store Builder 4.18.2 (но проблема актуальна на всех версиях). Также воспроизводится на вашем дев демо https://dev.demo.cs-cart.ru/stores/79e37de17780edf8/electronics/car-electronics/subwoofers/kfc-w3013ps/
Суть проблемы: Если у товара есть комплект со скидкой, то при добавлении всего комплекта в корзину не учитывается скидка на комплект
Как воспроизвести проблему: задать комплект со скидкой при помощи нативного модуля “Комплекты товаров” на странице товара с комплектов нажать на кнопку “Добавить все в корзину” и видим, что сумма во всплывающем окне корзины без учета скидки на комлект